El primer paso de cualquier análisis empírico es la formulación cuidadosa de la pregunta de interés. Esta puede consistir en poner a prueba cierto aspecto de una teoría económica o evaluar los efectos de una política gubernamental. En principio, los métodos econométricos sirven para responder a una amplia gama de preguntas.
En algunos casos, en particular los que se ocupan de probar las teorías económicas, se elabora un modelo económico formal, que consta de ecuaciones matemáticas que describen diversas relaciones.
En ocasiones, elaborar modelos económicos formales es el punto de partida del análisis empírico, pero es más común utilizar la teoría económica de modo menos formal o, incluso, confiar por entero en la intuición.
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